新钻研剖析种植草莓“祖先”基因组图谱

本报讯(记者卑劣丽)草莓具备紧张的祖先经济价钱以及营养价钱 ,今世八倍体种植草莓源头于两个八倍体家养种——弗州草莓以及智利草莓的新钻析种种间杂交 。克日 ,研剖因组中国迷信院昆明植物钻研所钻研员朱安丹课题组深入剖析了八倍体草莓的植草源头以及遗传分解特色。相关下场在线宣告于《做作-植物》 。莓基

朱安丹展现,图谱由于草莓属零星发育剖析波及未知的祖先祖先 、同源染色体交流以及不残缺谱系分选等下场 ,新钻析种八倍体草莓的研剖因组二倍体祖先下场至今仍存在较大争议。此外 ,植草八倍体草莓在驯化历程中的莓基亚基因组的同源倾向性表白及转变方式并不清晰。

该钻研提出了一套适用于多倍体的图谱ALLHiC迭代挂载流程 ,构建了两个八倍体家养草莓——弗州草莓以及智利草莓染色体水平的祖先高品质分型基因组 。钻研职员实现为了八倍体草莓亚基因组的新钻析种分说,并在此根基上接管差距的研剖因组合成措施重新追溯了八倍体草莓的二倍体祖先。

钻研服从更正了外洋学者在亚基因组调配上的过错,并进一步判断森林草莓以及饭沼草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先种。钻研还品评辩说了八倍体草莓在驯化历程中的同源倾向性表白分解,并基于空间四联体措施实现为了八倍体草莓的动态以及动态的同源倾向性合成 ,并判断到一些紧张的转录因子在驯化历程中爆发了表白偏倚 。

相关论文信息 :

https://doi.org/10.1038/s41477-023-01473-2

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